1895년 유인석(柳麟錫)의 호좌의진(湖左義陣)에서 활동하였고, 1905년 박세호(朴世和)와 함께 의병을 일으키기로 논의하다가 체포되었다.

1895년 명성황후가 시해되고, 이어서 단발령이 내려지자 의암 유인석은 강원도 영월(寧越)에서 호좌의진을 조직했다. 당시 윤응선은 스승인 박세화와 함께 경북 문경(聞慶)의 산중으로 들어가 거의하기로 계획하였으나, 호좌의진이 충주(忠州)에 도착하자 이에 참여하였다.

1905년 초에는 충북 청풍(淸風)에서 척사적 성격의 향약을 조직하고 스스로 도헌(都憲)이 되어 활동하면서 일진회를 배척하였다. 을사조약이 체결되자 월악산(月岳山) 용하동(用夏洞)에서 의거할 것을 의논하였으나 박세화의 갑작스런 발병으로 중단되었다. 이후 병으로 잠시 귀가하였다가 제천시(堤川市) 덕산면(德山面) 광천(廣川)에서 체포되어 옥고를 치렀다.

정부는 고인의 공훈을 기려 2015년에 건국포장을 추서하였다.

• 韓國史料叢書(國史編纂委員會, 1975) 제21집 471면
• 독립운동사자료집(독립운동사편찬위원회, 1971) 제1집 32, 67면
• 湖西義兵事蹟(李九榮, 1993) 484, 508면
• 국역 소의신편(의암학회, 2006) 419면
• 恒齋集(著 李正奎ㆍ發行處 奈堤文化硏究會, 1997) 亨 卷七 126면
• 晦堂集(著 尹膺善ㆍ發行人 尹烈相, 2003) 二 卷之三 41~43면